慢性ストレスを受けた動物やうつ病患者では脳内で炎症反応が生じていることが示唆されてきた。我々は、マウスの社会挫折ストレスを用いて、慢性ストレスが自然免疫受容体を介して内側前頭前皮質(medial prefrontal cortex; mPFC)のミクログリアを活性化し、神経細胞の樹状突起退縮やうつ様行動を促すことを示してきた。慢性ストレスによるミクログリア活性化は脳領域選択的であり、mPFCでは誘導されるが、側坐核では誘導されない。また、ミクログリア活性化はストレスの反復で次第に増強するプライミングを示す。従って、ミクログリアのストレス応答には脳領域選択的な転写・エピゲノム制御の関与が推測されるが、実態は不明である。本研究では、脳領域かつミクログリア選択的なエピゲノム解析を行い、ヒストンH3K27アセチル化を伴うスーパーエンハンサーがmPFCと側坐核のミクログリアのゲノム上で異なる分布を示すこと、この脳領域選択性は慢性ストレスにより生じることを見出した。このスーパーエンハンサーの変化には、mPFC選択的な局所的変化と、mPFCと側坐核で共に生じる広域的変化が含まれており、近傍の遺伝子の発現変化とも合致していた。さらに、慢性ストレスにより変化したスーパーエンハンサーのnucleosome-free領域には、異なる転写因子結合モチーフが濃縮していた。以上の結果は、慢性ストレスがミクログリアにおいて脳領域選択性の異なる複数の転写・エピゲノム制御を誘導し、ミクログリアのストレス応答を決定することを示唆している。